More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1126 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  93.14 
 
 		 1145 aa  1995    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1056 aa  2155    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1027 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1036 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 1109 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1006 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1123 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1094 aa  505  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1029 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1130 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1018 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 1033 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1176 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1095 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1056 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1079 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1046 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1081 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1043 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1068 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1095 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1045 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 937 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1056 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1086 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1033 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1062 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1086 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1144 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1130 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1148 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1127 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1031 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 913 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1138 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1026 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1036 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1013 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1161 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1038 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1026 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1034 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1020 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 953 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1128 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1061 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1148 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1047 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1019 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1168 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1146 aa  364  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1025 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1128 aa  357  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 1065 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1192 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1114 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1131 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1027 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 996 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1155 aa  347  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1104 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1100 aa  340  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1038 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 994 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1142 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1082 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1004 aa  334  5e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1000 aa  333  9e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1055 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1217 aa  330  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1124 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1181 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1028 aa  327  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 929 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 917 aa  325  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1117 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1010 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1066 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1039 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1060 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1074 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1064 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1164 aa  321  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1064 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1020 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1006 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 996 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1006 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1148 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1008 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1043 aa  314  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1173 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1036 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1037 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1062 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1011 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1177 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1161 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1010 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1036 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>