More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1460 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  40.76 
 
 		 1064 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  42.1 
 
 		 1082 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  39.7 
 
 		 1062 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  43.62 
 
 		 1083 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1189 aa  2421    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  59.92 
 
 		 1084 aa  1291    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  62.51 
 
 		 1202 aa  1524    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  54.48 
 
 		 1175 aa  1303    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  45.42 
 
 		 1060 aa  885    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  42.63 
 
 		 1077 aa  800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  39.84 
 
 		 1085 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  42.38 
 
 		 1096 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1155 aa  576  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1179 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1177 aa  546  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1148 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1181 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 1012 aa  539  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1164 aa  539  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 1161 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1122 aa  533  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1114 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1117 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.52 
 
 		 1023 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1177 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1116 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1038 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 1026 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1008 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1097 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 1128 aa  505  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1139 aa  506  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 1047 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 1144 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1006 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1010 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1192 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1128 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1127 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1036 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1124 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1055 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1052 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1130 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1075 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1102 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1066 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1161 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1132 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1058 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1033 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 1029 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 1020 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1140 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1168 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1144 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1049 aa  473  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.53 
 
 		 1063 aa  473  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1096 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1079 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 986 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1129 aa  463  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 		 1043 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 1002 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1147 aa  459  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1103 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1038 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1006 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1034 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1130 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 989 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 1050 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1079 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1168 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1076 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1188 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1076 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1017 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1155 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1146 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1106 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 1005 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1142 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1173 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1004 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1081 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1071 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1031 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1163 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1131 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 994 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1037 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1003 aa  439  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1087 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1043 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1034 aa  433  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1150 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1138 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1026 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1060 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>