More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0274 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  42.91 
 
 		 1175 aa  819    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  41.72 
 
 		 1060 aa  782    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  41.1 
 
 		 1082 aa  715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1062 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  43.77 
 
 		 1189 aa  817    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  63.47 
 
 		 1077 aa  1376    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1083 aa  2172    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  63.67 
 
 		 1096 aa  1389    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  42.28 
 
 		 1084 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  43.45 
 
 		 1202 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  39.15 
 
 		 1064 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 1085 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 1164 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1037 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1177 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1036 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1006 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 1049 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1012 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1128 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1181 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1161 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1155 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1066 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1075 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 1026 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 1055 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1008 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 1047 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1116 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1010 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1192 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1177 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1179 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1017 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.66 
 
 		 1063 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1052 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 996 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1034 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 994 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 1020 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.87 
 
 		 1023 aa  452  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1081 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 1029 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1051 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 1025 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1071 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 1065 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1122 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1155 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1038 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1097 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 982 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1051 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1114 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 996 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1161 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1128 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1038 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.12 
 
 		 1005 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.33 
 
 		 1043 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1034 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1148 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1117 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1010 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 1140 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1053 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 1011 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 1002 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1079 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1050 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1150 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1006 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1102 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1023 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1019 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 1000 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.61 
 
 		 1041 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1124 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1027 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1004 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1026 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1023 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1130 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1080 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1173 aa  412  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1131 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1137 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1096 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1076 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1028 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1049 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1076 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1042 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1103 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 979 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>