More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1601 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1055 aa  2143    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  40.02 
 
 		 1047 aa  700    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1082 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1064 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1062 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1085 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1026 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1060 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 1175 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1096 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 1189 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 1020 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1202 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1012 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1077 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1161 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1164 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 1083 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1084 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1006 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1033 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1052 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1037 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1181 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 1177 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1038 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.19 
 
 		 1002 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.22 
 
 		 1023 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 		 1063 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1155 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1075 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1139 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1147 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1066 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 1034 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.9 
 
 		 1005 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1000 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1050 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1129 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1128 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1192 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1179 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 1049 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 982 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1036 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1177 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1116 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1155 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1124 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1039 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1040 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1010 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 996 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1079 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1161 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1076 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1127 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 1043 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1051 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1131 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1034 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1038 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1010 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1138 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1146 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1130 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1114 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1017 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1076 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1168 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1128 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1027 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1081 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1058 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1102 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1150 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1071 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1013 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 979 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1026 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1019 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1036 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1023 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1071 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1006 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1008 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1103 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 994 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 1025 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1013 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1050 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1079 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 1041 aa  361  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1041 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1043 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1042 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1076 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1148 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>