More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2207 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1161 aa  2346    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1155 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1114 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1164 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1128 aa  556  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1177 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 1026 aa  536  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1161 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1122 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 1052 aa  529  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  33.45 
 
 		 1179 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1097 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1192 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1066 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1117 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1148 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1181 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1124 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1139 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1027 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1085 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1128 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.3 
 
 		 1002 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 1189 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1060 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1082 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1079 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1064 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1075 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1116 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1177 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1029 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.37 
 
 		 1023 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1008 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1038 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1010 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 986 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 1050 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1103 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 1020 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1132 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 982 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 		 1063 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1038 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1129 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1012 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 1037 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1079 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1150 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1062 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 989 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1202 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1175 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1168 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1155 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1076 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1127 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1023 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.99 
 
 		 1043 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1049 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1137 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1006 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 1043 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1071 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1144 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1102 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1106 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.3 
 
 		 1005 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 1033 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1076 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1039 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1173 aa  436  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1026 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1036 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1163 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 976 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1058 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1116 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1119 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1154 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1152 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 1011 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 1000 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1150 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 1040 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1137 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1006 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 994 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1071 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1083 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1066 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 996 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 1025 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1051 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1010 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1041 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1154 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.34 
 
 		 1041 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1120 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>