More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4194 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  51.12 
 
 		 1117 aa  984    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  39.06 
 
 		 1038 aa  673    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1000 aa  2021    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  41.07 
 
 		 1161 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1124 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  50.86 
 
 		 1114 aa  992    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  40.66 
 
 		 1037 aa  708    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  38.82 
 
 		 1181 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  38.73 
 
 		 1029 aa  629  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  37.02 
 
 		 1155 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37.92 
 
 		 1177 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 1038 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 1019 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  38.84 
 
 		 989 aa  602  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1097 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1128 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 1039 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1066 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  36.07 
 
 		 1041 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 1006 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 1071 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 982 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 1012 aa  568  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1116 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 1008 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  37.46 
 
 		 979 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 996 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 1050 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 994 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.61 
 
 		 1051 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 1155 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1148 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 1023 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1079 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  35.52 
 
 		 1051 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1076 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  35.3 
 
 		 1063 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1152 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1039 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1173 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1132 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 1026 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1096 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1076 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1076 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 1028 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1129 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1064 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1010 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 1071 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1059 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1017 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1023 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 986 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 		 1013 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1014 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1150 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1147 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1071 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1023 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1027 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.41 
 
 		 1023 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1164 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1122 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1023 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  35.23 
 
 		 1002 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1163 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1062 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1053 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1006 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1060 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1081 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1006 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 1128 aa  496  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1106 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1052 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1198 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1049 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1179 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1079 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 993 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 1080 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1075 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1040 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1177 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 1033 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1050 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1172 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1020 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.27 
 
 		 1030 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1042 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1140 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 996 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32.98 
 
 		 1018 aa  475  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1168 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1066 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1060 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1154 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>