More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3420 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  92.01 
 
 		 1076 aa  2019    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  58.72 
 
 		 1051 aa  1207    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  70.34 
 
 		 1076 aa  1460    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  43.95 
 
 		 1038 aa  824    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  53.58 
 
 		 1155 aa  1072    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1076 aa  2194    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  40.73 
 
 		 1161 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1114 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 1037 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  37.02 
 
 		 1117 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1113 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1181 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 1029 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 1038 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  35.65 
 
 		 1177 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1008 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 		 1128 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1132 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1000 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1124 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.65 
 
 		 1027 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1155 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1006 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 1050 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1028 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1066 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1071 aa  533  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1039 aa  526  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1103 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1006 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1097 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 		 996 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  36.38 
 
 		 1034 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 		 1017 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1096 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 1019 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1012 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.9 
 
 		 1041 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 994 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1042 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1039 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.45 
 
 		 1051 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1059 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1116 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 982 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 996 aa  503  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1043 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1163 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1010 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1122 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1148 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1081 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1026 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 1140 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1129 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1064 aa  493  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1102 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1010 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1152 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1071 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 986 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1023 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1168 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 986 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1079 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1041 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1075 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 989 aa  482  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1137 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1014 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1147 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1023 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 1144 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1150 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1105 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.53 
 
 		 1063 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1023 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1006 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  32.61 
 
 		 1019 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1013 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1154 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 999 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1202 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1079 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1071 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 1080 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1060 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1189 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1164 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1119 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1161 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1025 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1082 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1168 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1021 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1173 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1087 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1060 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>