More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1708 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  42.68 
 
 		 1168 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  44.2 
 
 		 996 aa  831    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  42.19 
 
 		 1017 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  38.21 
 
 		 1030 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 1050 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1042 aa  2113    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  41.19 
 
 		 1034 aa  784    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  43.42 
 
 		 1006 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  37.49 
 
 		 1102 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 986 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1147 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.13 
 
 		 1096 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 1144 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 1105 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 1037 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.55 
 
 		 1029 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1077 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1177 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1038 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 979 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 993 aa  529  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1161 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1006 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 1050 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 1013 aa  516  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1079 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1008 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1132 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1087 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1076 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1076 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1155 aa  493  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1076 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 1008 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1051 aa  489  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1114 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 1106 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1155 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1181 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1117 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1000 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1124 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1066 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1033 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1173 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1154 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1051 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1023 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1028 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1010 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1023 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1026 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1128 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1039 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1012 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1027 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1122 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1163 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1152 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 994 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 996 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1039 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 1025 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 1041 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 982 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1071 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1037 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 986 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 989 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1097 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1060 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  32.13 
 
 		 1034 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1071 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1006 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1081 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 1019 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1060 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1064 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1150 aa  433  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1038 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1079 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1010 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 		 1063 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1127 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1116 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1062 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1075 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 1047 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1202 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 1023 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1071 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1082 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1053 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1139 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1031 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1049 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1059 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1164 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>