More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3966 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  46.1 
 
 		 1152 aa  974    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  38.92 
 
 		 1040 aa  665    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1150 aa  2328    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  48.12 
 
 		 1096 aa  931    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  49.57 
 
 		 1028 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  51.12 
 
 		 1051 aa  996    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  45.51 
 
 		 1059 aa  921    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  43.66 
 
 		 1154 aa  875    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  47.1 
 
 		 1163 aa  942    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  46.77 
 
 		 1132 aa  1011    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 1080 aa  623  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 1053 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.52 
 
 		 1161 aa  619  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1049 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1116 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 1037 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1038 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1129 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1114 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 1029 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1177 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1124 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1155 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1039 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1006 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.13 
 
 		 1041 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1071 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1117 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1181 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 1080 aa  522  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 1063 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1154 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1079 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1008 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1000 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1051 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 1019 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1148 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1021 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1097 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1131 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1050 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 1140 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1012 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1173 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 986 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 989 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1066 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1155 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1128 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 982 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1122 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1010 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1127 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1164 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 1025 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1076 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1147 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 1071 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1039 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1023 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1096 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1060 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.6 
 
 		 1023 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1006 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 994 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1102 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1076 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1076 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1109 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1027 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 979 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1077 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1023 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1014 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1066 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1081 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1144 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 996 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1013 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1113 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1154 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1041 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1172 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1119 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1043 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 1038 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1052 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1026 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1119 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.13 
 
 		 1063 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1042 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 999 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1116 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1023 aa  425  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1161 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1103 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1043 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1120 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1106 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>