More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4548 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  41.11 
 
 		 1093 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 1111 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  40.26 
 
 		 1007 aa  685    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 1099 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  38.79 
 
 		 1011 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  36.94 
 
 		 1109 aa  704    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  36.88 
 
 		 1108 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  38.79 
 
 		 1009 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.42 
 
 		 1089 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  38.32 
 
 		 1089 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  38.76 
 
 		 1101 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  44.69 
 
 		 1119 aa  861    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  40.11 
 
 		 1127 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  35.51 
 
 		 1092 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1102 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1113 aa  730    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 1138 aa  768    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  38.61 
 
 		 1101 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  39.17 
 
 		 1080 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1109 aa  2268    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1127 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1014 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  40.54 
 
 		 894 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1104 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1132 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1116 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1155 aa  453  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1150 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1038 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1163 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1161 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1177 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1181 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1122 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1019 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1027 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 1140 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1110 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 1037 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1010 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1079 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1050 aa  423  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1053 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1071 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1152 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1154 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 982 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1114 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 999 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1066 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1124 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 1043 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 986 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1023 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1049 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1129 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1148 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1116 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1014 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1120 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1028 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1051 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1173 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1128 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1147 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 989 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1155 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1062 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 997 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1096 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1117 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1029 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1097 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  30.55 
 
 		 925 aa  389  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 1041 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1017 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1039 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1146 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1161 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1127 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1138 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1102 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1154 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1006 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1039 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1106 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1012 aa  364  6e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1071 aa  364  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1096 aa  364  6e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 1011 aa  363  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1066 aa  363  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 996 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1040 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1008 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1037 aa  362  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1051 aa  360  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1076 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1139 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1144 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 1154 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>