More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2854 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38 
 
 		 1089 aa  715    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  39.28 
 
 		 1108 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1111 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  40.36 
 
 		 1113 aa  818    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  38.67 
 
 		 1007 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1138 aa  2310    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1099 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  36.87 
 
 		 1102 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  40.33 
 
 		 1093 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 1101 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  40.94 
 
 		 1109 aa  833    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 1109 aa  774    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 1101 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  39.67 
 
 		 1119 aa  764    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  37.7 
 
 		 1080 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  41.7 
 
 		 1127 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1127 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  40.31 
 
 		 894 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  38.65 
 
 		 1089 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  37.21 
 
 		 1011 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  38.48 
 
 		 1009 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1092 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  38.97 
 
 		 1014 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1104 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1110 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1132 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1150 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 1140 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1129 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1027 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1116 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1177 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1163 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1123 aa  383  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  31.84 
 
 		 925 aa  382  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1023 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1146 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1124 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 1014 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1169 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1154 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 1037 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1114 aa  364  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1161 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1120 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1038 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 1119 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 997 aa  360  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1097 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1128 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 999 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1116 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1152 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1000 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1008 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1131 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1154 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1050 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1062 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1077 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1127 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 982 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1043 aa  343  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.95 
 
 		 1024 aa  343  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1029 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1139 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1192 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1181 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 979 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1148 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1010 aa  337  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1117 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1071 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1028 aa  332  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 989 aa  332  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1019 aa  332  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1066 aa  328  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1122 aa  327  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1158 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1013 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1079 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1076 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1025 aa  321  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1028 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1051 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1173 aa  318  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1155 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1006 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.95 
 
 		 1019 aa  316  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1096 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.41 
 
 		 1041 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1041 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1076 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1006 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1039 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1053 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1040 aa  311  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1106 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1138 aa  310  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>