More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0136 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  43.96 
 
 		 1099 aa  864    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  36.88 
 
 		 1109 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 1080 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  39.23 
 
 		 1093 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  38.56 
 
 		 1102 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  38.86 
 
 		 1111 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1119 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  39.42 
 
 		 1109 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  42.08 
 
 		 1014 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1108 aa  2262    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  39.28 
 
 		 1138 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  41.53 
 
 		 1089 aa  793    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  38.08 
 
 		 1101 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1127 aa  742    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 1089 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1101 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  38.36 
 
 		 1007 aa  602  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  38.05 
 
 		 1011 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  36.02 
 
 		 1113 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  37.55 
 
 		 1009 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  37.59 
 
 		 894 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1127 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1092 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1104 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1132 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1155 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1010 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1177 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1116 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1037 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1110 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1038 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1027 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1163 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1120 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1161 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1114 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1129 aa  356  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1152 aa  354  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1013 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 999 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 989 aa  347  5e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1029 aa  348  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 982 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1154 aa  347  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1050 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1019 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1181 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1071 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1128 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1014 aa  344  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1140 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1028 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1023 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1079 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1117 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 1000 aa  337  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1062 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1177 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1071 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1173 aa  330  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1155 aa  327  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 1119 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1160 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1116 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.81 
 
 		 1024 aa  321  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1008 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1122 aa  318  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.58 
 
 		 1041 aa  317  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1124 aa  317  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 997 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1039 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1147 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1150 aa  314  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1066 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1051 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1102 aa  313  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1106 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1006 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1076 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1081 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1154 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1097 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.53 
 
 		 1019 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1076 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1060 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.26 
 
 		 925 aa  307  9.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1039 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1103 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1119 aa  304  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1096 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 993 aa  302  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 986 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1076 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1127 aa  301  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1047 aa  300  7e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1042 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1177 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 979 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1161 aa  298  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>