More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3206 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1104 aa  2264    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1127 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1138 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1093 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1109 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1119 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1110 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1109 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1080 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1099 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1101 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1089 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1108 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1102 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1089 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1127 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 1007 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1113 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  30.73 
 
 		 1011 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1092 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  30.44 
 
 		 1009 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1014 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1111 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1101 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 894 aa  370  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1014 aa  278  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1116 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1129 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1097 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1027 aa  260  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 1043 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1096 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1071 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1128 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1066 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1148 aa  241  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 996 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 986 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 1019 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1050 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1079 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1124 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1155 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 982 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1119 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1177 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 997 aa  234  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1006 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1023 aa  231  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1037 aa  230  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1038 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1008 aa  229  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 		 1177 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 992 aa  228  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1050 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1106 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 1029 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1086 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1006 aa  226  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  23.02 
 
 		 1122 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 993 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1028 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1132 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 999 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1160 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 1154 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1079 aa  220  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.27 
 
 		 1030 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1155 aa  217  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  24.4 
 
 		 1019 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1139 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 989 aa  216  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1062 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1102 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 979 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1062 aa  214  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  24.71 
 
 		 1041 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 1140 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  23.06 
 
 		 1080 aa  212  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1071 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 1071 aa  211  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 1128 aa  211  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1023 aa  210  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1043 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1051 aa  209  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1076 aa  209  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 984 aa  208  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 1011 aa  207  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 1026 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 1164 aa  206  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 1077 aa  205  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 1033 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 1039 aa  202  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1168 aa  198  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1024 aa  198  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  24.83 
 
 		 1047 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 1014 aa  196  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 1008 aa  194  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 1039 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 994 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>