More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4373 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  41.96 
 
 		 1080 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  60.46 
 
 		 1007 aa  1243    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  43.09 
 
 		 1119 aa  722    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  56.47 
 
 		 1011 aa  1150    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  42.45 
 
 		 1101 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1009 aa  2063    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  39.86 
 
 		 1111 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  39.8 
 
 		 1089 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  38.85 
 
 		 1092 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  39.53 
 
 		 1099 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  44.41 
 
 		 1109 aa  767    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  41.67 
 
 		 1113 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.79 
 
 		 1109 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  40.3 
 
 		 1127 aa  663    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  41.84 
 
 		 1093 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  38.48 
 
 		 1101 aa  632  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  38.48 
 
 		 1138 aa  623  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  38.06 
 
 		 1102 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  41.9 
 
 		 894 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  37.55 
 
 		 1108 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.47 
 
 		 1089 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  38.43 
 
 		 1014 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1127 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1110 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1023 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 1014 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1027 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1104 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1010 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1128 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 999 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1043 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1038 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 982 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1037 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1161 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1053 aa  360  9e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 1029 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1120 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1173 aa  357  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1132 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1028 aa  354  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1177 aa  353  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1000 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1079 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1049 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1071 aa  350  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1155 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 986 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 989 aa  347  6e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.85 
 
 		 1019 aa  346  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1181 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1154 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1013 aa  344  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.76 
 
 		 1024 aa  343  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.42 
 
 		 925 aa  342  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1129 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1124 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1116 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 1019 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1066 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1050 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1033 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 997 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1114 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1155 aa  333  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1071 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1152 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1097 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1096 aa  323  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1021 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1150 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 1041 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.18 
 
 		 1023 aa  321  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1117 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1051 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 1028 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1103 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1059 aa  317  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1079 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.08 
 
 		 1002 aa  314  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1076 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1039 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1177 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1026 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1147 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 1005 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1006 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 996 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 992 aa  308  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1102 aa  307  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1012 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1025 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1148 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1164 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 994 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1122 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1039 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1144 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 979 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>