More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0537 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1024 aa  2092    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1006 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  32.24 
 
 		 925 aa  438  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 999 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1027 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1120 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 997 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1023 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  30.78 
 
 		 1035 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1010 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1119 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1161 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 992 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1028 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1043 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1160 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1129 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1014 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1066 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1037 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1039 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1062 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1038 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 994 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.47 
 
 		 1024 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 		 1002 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1128 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1140 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1071 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1071 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 989 aa  362  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.34 
 
 		 1019 aa  360  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 996 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1013 aa  357  5e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1173 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1021 aa  351  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1114 aa  351  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.39 
 
 		 1041 aa  350  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1086 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1012 aa  349  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1109 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1164 aa  347  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1041 aa  347  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1177 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1051 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1181 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1018 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1177 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 975 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  28.57 
 
 		 1017 aa  341  4e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1117 aa  341  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1058 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 1028 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1025 aa  337  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1155 aa  337  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1028 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 996 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1079 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 1030 aa  335  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1008 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 994 aa  333  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1122 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1059 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1132 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1012 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1148 aa  330  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1040 aa  330  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 986 aa  330  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 982 aa  330  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1094 aa  330  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1147 aa  328  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1062 aa  327  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1096 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1033 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 1029 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1116 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1124 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 1026 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 1003 aa  324  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1019 aa  324  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1049 aa  323  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1079 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1109 aa  321  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1070 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1006 aa  321  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1102 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1050 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 1043 aa  318  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 993 aa  317  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1017 aa  317  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1034 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1064 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1004 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1020 aa  315  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1000 aa  314  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1177 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1144 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1161 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>