More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3214 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1138 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 1109 aa  713    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  40.52 
 
 		 1102 aa  761    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  39.64 
 
 		 1007 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  40.86 
 
 		 1011 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  38.58 
 
 		 1099 aa  744    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  36.85 
 
 		 1101 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  40.5 
 
 		 1009 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  40.66 
 
 		 1101 aa  750    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 1109 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 		 1093 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  43.05 
 
 		 1089 aa  888    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  37.31 
 
 		 1113 aa  653    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  38.86 
 
 		 1108 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  42.07 
 
 		 1127 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1111 aa  2245    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 1119 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  37.41 
 
 		 1080 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.96 
 
 		 1089 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  41.41 
 
 		 1014 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  39.96 
 
 		 894 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1092 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1127 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1023 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1104 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1027 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1010 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1129 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1161 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1155 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1132 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 1071 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1110 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1177 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 999 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1079 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1050 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1124 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1128 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1037 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 1019 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1097 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1116 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 1043 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 989 aa  353  8.999999999999999e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1066 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 997 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1181 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1119 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1013 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 982 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1120 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 1029 aa  346  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1038 aa  343  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1148 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1140 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1152 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1077 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 1000 aa  334  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1117 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1114 aa  334  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1028 aa  334  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1039 aa  333  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1173 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1051 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1071 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1008 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1155 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1096 aa  325  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1147 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1150 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.11 
 
 		 1019 aa  320  7e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1102 aa  320  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1036 aa  320  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1040 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1103 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1161 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1062 aa  317  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.23 
 
 		 925 aa  317  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1051 aa  317  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1122 aa  317  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1037 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1116 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1028 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1119 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1025 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 984 aa  314  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1106 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1076 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1154 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 996 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1053 aa  311  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1076 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.32 
 
 		 1024 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 986 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1059 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1076 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1154 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1172 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>