More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0454 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1006 aa  2034    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1027 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  36.75 
 
 		 1023 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 992 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1010 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1161 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1024 aa  489  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 1014 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1038 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1086 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 1037 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1177 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 994 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1039 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 999 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 1043 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1120 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1152 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  33.64 
 
 		 925 aa  446  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1066 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1008 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1155 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1051 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 982 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1114 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1079 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 1029 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1181 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 997 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 1140 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.15 
 
 		 1019 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1124 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1071 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  31.56 
 
 		 1024 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1132 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 996 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1050 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 1119 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 1041 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 989 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1028 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1071 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 986 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 1026 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1028 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 1019 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1065 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1006 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1012 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1053 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 994 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1051 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1028 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1017 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1117 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1059 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 1025 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1082 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1122 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1128 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 996 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1064 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1062 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 979 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1096 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1164 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.02 
 
 		 1035 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1173 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 		 1063 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1148 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1039 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1096 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1097 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  30.85 
 
 		 1017 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1150 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.81 
 
 		 1023 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1062 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1163 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1021 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1023 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1103 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1085 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1155 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1147 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1154 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1034 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1154 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1038 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1066 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1160 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1042 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1036 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1177 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1041 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.01 
 
 		 1002 aa  373  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1116 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1006 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 986 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1000 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1109 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>