More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3148 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1119 aa  2273    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  42.64 
 
 		 1109 aa  845    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1027 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1161 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1140 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  32.86 
 
 		 925 aa  429  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1043 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1023 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1006 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1028 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1160 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1177 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1129 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1181 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1177 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 992 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1014 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1062 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 989 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1010 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1066 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1024 aa  396  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 1071 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1037 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1128 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.75 
 
 		 1024 aa  393  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1080 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1116 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1127 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 997 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1132 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1058 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1155 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1147 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1155 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 986 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 999 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 1063 aa  373  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1114 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 994 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 1029 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1028 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1124 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 1035 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1086 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.55 
 
 		 1019 aa  365  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1120 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1051 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1039 aa  363  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1102 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1079 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 982 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1062 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1154 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1202 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1099 aa  361  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1006 aa  360  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1012 aa  360  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1038 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1138 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1008 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 		 1041 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1060 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1109 aa  354  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1051 aa  353  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1064 aa  353  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1019 aa  353  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1000 aa  353  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1148 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1071 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1026 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 1026 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1103 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1023 aa  351  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1122 aa  351  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1025 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1154 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1189 aa  348  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1076 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1076 aa  347  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1175 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1036 aa  346  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1066 aa  346  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 1034 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1018 aa  345  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1146 aa  345  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1075 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1084 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1089 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 996 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1096 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1076 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1006 aa  340  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1152 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1020 aa  336  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1062 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1053 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 1003 aa  335  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 1002 aa  335  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1094 aa  335  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>