More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0456 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 997 aa  2022    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  41.14 
 
 		 925 aa  709    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1023 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 		 1027 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1120 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 1037 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 999 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1014 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1010 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 1043 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1161 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1177 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1066 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 982 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1071 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 1028 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1173 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  31.13 
 
 		 1024 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.69 
 
 		 1019 aa  439  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1116 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 986 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1140 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1006 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1071 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 1050 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  30.71 
 
 		 1035 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1181 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1155 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1038 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1148 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1062 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 996 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1097 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1079 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 1029 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 994 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 1025 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1122 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1024 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1066 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 989 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1117 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1006 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1039 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1114 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1008 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1028 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 992 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1051 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.26 
 
 		 1041 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1128 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1000 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 		 1047 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1023 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1034 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1017 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1021 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1129 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1103 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1033 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1109 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 994 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1119 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 979 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 1154 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1177 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1051 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1132 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1026 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.95 
 
 		 1063 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1124 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1081 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1089 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1086 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1079 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1039 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1038 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1036 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1019 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1006 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1059 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1172 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1198 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1076 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 		 1023 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1155 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1023 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1041 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1076 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1043 aa  364  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1109 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1062 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1052 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1006 aa  360  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1094 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1138 aa  357  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1093 aa  357  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1050 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>