More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0445 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1043 aa  2122    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1181 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1161 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1028 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 982 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1132 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1079 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1155 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1177 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1066 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1051 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1114 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1059 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1148 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 1140 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1071 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 1026 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 		 1041 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 994 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1053 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1129 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.05 
 
 		 1063 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1128 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1037 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1008 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1096 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 986 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1198 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1150 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 996 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1152 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1124 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 1023 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1175 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1127 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.98 
 
 		 1080 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1051 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1012 aa  412  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1059 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1163 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 1000 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1079 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1122 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1026 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1137 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1021 aa  409  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1020 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1070 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 986 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1023 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1006 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1119 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1039 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1020 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1071 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1164 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1063 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.25 
 
 		 1005 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 1029 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1040 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1143 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1039 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1117 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1047 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 989 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1019 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1192 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1147 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1076 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1103 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1082 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1076 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1066 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1189 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1025 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1155 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1062 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1172 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  28.98 
 
 		 1035 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1011 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1058 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1116 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1052 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1177 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  30.52 
 
 		 1005 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1138 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1041 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 979 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 1033 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1010 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1076 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1064 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 1041 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1075 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1071 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1154 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1097 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>