More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2645 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1143 aa  2312    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  39.98 
 
 		 1099 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  59.04 
 
 		 1059 aa  1266    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  53.91 
 
 		 1070 aa  1184    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 1117 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1128 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1110 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1117 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1129 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1123 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1177 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1132 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1127 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1181 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1114 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1154 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1116 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1140 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1037 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 1128 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1154 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1038 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.29 
 
 		 1019 aa  416  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1152 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1006 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1155 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1124 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1139 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1079 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1192 aa  410  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1117 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1043 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1027 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1066 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1155 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1051 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1077 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1161 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1039 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1043 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1086 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1050 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1164 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1173 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1023 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1012 aa  396  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1163 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1160 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1131 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1014 aa  390  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1071 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1139 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1148 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 989 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1029 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 1026 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1053 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1146 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1122 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1017 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1168 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 999 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1120 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1038 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1097 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1042 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1006 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1064 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1008 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 1028 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1028 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1130 aa  366  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1128 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1076 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1076 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1010 aa  364  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1082 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1085 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1147 aa  363  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1103 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1034 aa  361  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1071 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1052 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1161 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1026 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1010 aa  360  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1023 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1060 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.66 
 
 		 1024 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1039 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1179 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.63 
 
 		 1023 aa  358  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1096 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1062 aa  357  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1051 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1079 aa  357  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 996 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1101 aa  353  8e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 996 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1034 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>