More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2062 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  45.95 
 
 		 1128 aa  956    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1110 aa  2273    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1099 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 1059 aa  602  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 		 1070 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1143 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1117 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1117 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1177 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1181 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1122 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1060 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1082 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1047 aa  350  8e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1102 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1066 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 1043 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1064 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1038 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 1047 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1026 aa  340  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1132 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1023 aa  335  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1076 aa  334  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1062 aa  333  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1105 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1147 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1039 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1144 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1119 aa  330  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1116 aa  330  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1042 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 996 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1079 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1076 aa  327  9e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 993 aa  327  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1046 aa  327  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1050 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1034 aa  323  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 986 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1148 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1037 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1034 aa  318  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1142 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1071 aa  318  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1076 aa  313  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1079 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1053 aa  312  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1038 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 1020 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 1041 aa  305  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 992 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1041 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1160 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1127 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1085 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1172 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1052 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 996 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1083 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1077 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1042 aa  297  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1130 aa  297  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1036 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1188 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1217 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1173 aa  295  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 999 aa  294  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1028 aa  294  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1043 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1018 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1012 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 1055 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1138 aa  288  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1019 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1131 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1155 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1096 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1013 aa  282  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1106 aa  281  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1033 aa  281  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1154 aa  281  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1095 aa  281  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1003 aa  278  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1024 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1013 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  25.65 
 
 		 1095 aa  272  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1057 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 1175 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1020 aa  264  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1014 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1100 aa  261  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1128 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1189 aa  258  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1190 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 1048 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1158 aa  250  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1164 aa  250  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  25.87 
 
 		 1024 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>