More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2627 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1117 aa  2261    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  36.27 
 
 		 1070 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1099 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 1059 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1143 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1128 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1110 aa  502  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1117 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1155 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1181 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1132 aa  353  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1039 aa  337  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1066 aa  334  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1014 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1038 aa  334  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1026 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1060 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1023 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1127 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1029 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1082 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1129 aa  326  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1020 aa  320  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1192 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 994 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1027 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1028 aa  318  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1155 aa  318  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  27.23 
 
 		 1018 aa  315  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1021 aa  310  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1076 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1096 aa  307  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1064 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1076 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1177 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1017 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1019 aa  303  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 1047 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1013 aa  303  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 996 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1077 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1154 aa  298  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1173 aa  297  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1012 aa  298  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1033 aa  297  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1096 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1016 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1006 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 996 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1024 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 993 aa  292  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1154 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1058 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 1080 aa  289  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1063 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1084 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1062 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1071 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 989 aa  289  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1198 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 1175 aa  287  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1013 aa  287  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1034 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1189 aa  284  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1113 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 1063 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1076 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1137 aa  282  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1085 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1155 aa  281  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1062 aa  281  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.56 
 
 		 1019 aa  279  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1046 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1202 aa  278  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1071 aa  277  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1040 aa  277  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1079 aa  277  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1168 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1105 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1025 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1085 aa  275  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1179 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1038 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1042 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1056 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1130 aa  264  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1104 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1010 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1119 aa  259  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1077 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 1055 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1150 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1131 aa  254  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1130 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1125 aa  251  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1042 aa  251  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1160 aa  250  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1047 aa  250  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1139 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1161 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>