More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1574 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1155 aa  2348    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1160 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1062 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1060 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1181 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1076 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1128 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1028 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1076 aa  317  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1084 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1130 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1076 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1051 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1070 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1099 aa  301  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1077 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 1047 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1096 aa  295  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1189 aa  294  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 1111 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1082 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1024 aa  288  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1110 aa  282  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1023 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1037 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1117 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1085 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1155 aa  277  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1079 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1059 aa  274  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1164 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1105 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1055 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1086 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1046 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1024 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1140 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  25.85 
 
 		 1129 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1143 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 1035 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1077 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 1119 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.67 
 
 		 925 aa  232  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1135 aa  231  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1185 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1043 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1053 aa  227  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1109 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1057 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1218 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  24.61 
 
 		 1211 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 1050 aa  221  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1129 aa  221  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1020 aa  218  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1038 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1147 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1219 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1046 aa  210  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1014 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1117 aa  205  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.49 
 
 		 1024 aa  204  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 1063 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 1154 aa  201  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1027 aa  201  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1127 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 999 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1028 aa  198  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1034 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1023 aa  197  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 		 1237 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 1030 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 997 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1047 aa  196  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1100 aa  195  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 1008 aa  194  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1114 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  42.75 
 
 		 1028 aa  194  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1128 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 989 aa  193  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 		 1000 aa  193  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 986 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 1071 aa  193  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1137 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1008 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1192 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1229 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1063 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1172 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1066 aa  189  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  43.38 
 
 		 1080 aa  188  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  33.41 
 
 		 1137 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 1038 aa  186  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1010 aa  185  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 1005 aa  184  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1017 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1023 aa  184  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1037 aa  184  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1161 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 1034 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1059 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>