More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6155 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1229 aa  2520    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  43.42 
 
 		 1211 aa  1027    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  40.92 
 
 		 1101 aa  841    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1161 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1203 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 1181 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1198 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1205 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1198 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 1185 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1189 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1202 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1199 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1204 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1175 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1218 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1230 aa  364  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1187 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1220 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1190 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1096 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.53 
 
 		 1111 aa  309  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1219 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1105 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 1085 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1116 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1143 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 1219 aa  247  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1017 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 1154 aa  236  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1077 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1034 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1160 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1050 aa  224  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1136 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1012 aa  220  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1039 aa  217  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  22.91 
 
 		 1135 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 1147 aa  215  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1028 aa  212  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 1128 aa  212  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 1008 aa  211  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1119 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1006 aa  208  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1190 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1026 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 1037 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1041 aa  201  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1027 aa  201  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1146 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 1138 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.37 
 
 		 925 aa  193  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1163 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 1125 aa  190  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1137 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1155 aa  190  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1028 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 1114 aa  187  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1154 aa  181  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  22.23 
 
 		 1198 aa  178  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1130 aa  173  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1124 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1123 aa  172  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1158 aa  171  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 1217 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 1048 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 1031 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1086 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 1018 aa  167  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1101 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1146 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1176 aa  166  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1109 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1127 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 1177 aa  162  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1132 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1155 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1150 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1138 aa  158  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1113 aa  155  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1064 aa  155  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1148 aa  151  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1079 aa  151  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1116 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1101 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 1058 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 1189 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1140 aa  146  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1148 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1127 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1109 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1062 aa  145  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1166 aa  144  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1023 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1099 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1037 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1139 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1097 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 999 aa  142  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1169 aa  142  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>