More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2352 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1085 aa  2201    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1175 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1199 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1096 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1187 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1190 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1181 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1230 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1218 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1189 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 1185 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1203 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1198 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1161 aa  297  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.96 
 
 		 1211 aa  277  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1229 aa  277  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1204 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1202 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1198 aa  270  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1205 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 		 1111 aa  234  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1101 aa  234  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1219 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1135 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1038 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 1219 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1155 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1047 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1006 aa  184  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  23.69 
 
 		 989 aa  183  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1136 aa  182  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 1150 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1079 aa  174  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 1050 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1122 aa  171  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1148 aa  167  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1161 aa  167  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1037 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1076 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 996 aa  161  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1119 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  25.23 
 
 		 1018 aa  157  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1163 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1040 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 1158 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 1023 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1109 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1164 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1154 aa  152  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1150 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 1038 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1060 aa  148  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1036 aa  147  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  21.59 
 
 		 1119 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1006 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 1036 aa  142  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 1085 aa  141  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  26.11 
 
 		 925 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 1237 aa  138  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1026 aa  137  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1028 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 1005 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 1177 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1114 aa  131  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 1004 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1154 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  23.31 
 
 		 1137 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1023 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1125 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 979 aa  127  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1062 aa  127  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1120 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1181 aa  125  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 1164 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1103 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1034 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 1052 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 1086 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 1055 aa  121  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 1139 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 1026 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 		 1047 aa  120  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 1019 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.43 
 
 		 1024 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 1043 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 1217 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1042 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1051 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1027 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  23.15 
 
 		 979 aa  116  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1039 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 996 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1028 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 1041 aa  115  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1177 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1014 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1013 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1017 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.9 
 
 		 1041 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>