More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4781 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  52.99 
 
 		 1135 aa  1185    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  42.26 
 
 		 1237 aa  889    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  62.57 
 
 		 1219 aa  1422    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  43.73 
 
 		 1114 aa  921    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  61.6 
 
 		 1136 aa  1351    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1119 aa  2271    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  55.47 
 
 		 1219 aa  1204    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  28.41 
 
 		 1111 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1220 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1203 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1198 aa  295  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1114 aa  293  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1161 aa  289  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1181 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1006 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1037 aa  270  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1010 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 994 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1101 aa  269  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1181 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1062 aa  268  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 996 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1132 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 982 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1053 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1079 aa  265  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1086 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1012 aa  263  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1029 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1096 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1152 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 1043 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1050 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1117 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1187 aa  257  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 1066 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1124 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1120 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1105 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1140 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1137 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  26.45 
 
 		 925 aa  254  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1085 aa  254  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 1185 aa  254  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 1189 aa  252  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 996 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.29 
 
 		 1019 aa  251  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1122 aa  251  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 1006 aa  250  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 999 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 1211 aa  248  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 989 aa  247  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1204 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 1158 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1205 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1014 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1154 aa  244  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 1041 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1041 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1103 aa  242  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1008 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 1035 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1202 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1155 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1039 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1175 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1060 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1082 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1148 aa  234  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1051 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1084 aa  234  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 1030 aa  234  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 1023 aa  234  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1047 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1096 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1229 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1199 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1064 aa  231  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1177 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1127 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1028 aa  229  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1034 aa  229  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1109 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1037 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1062 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 1154 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1109 aa  228  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1060 aa  228  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1028 aa  227  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1177 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1012 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1034 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1076 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1003 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1013 aa  223  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 1079 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 1202 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1017 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 1049 aa  222  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1150 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>