More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2008 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1198 aa  2440    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1229 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1161 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 1211 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1101 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 1185 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1198 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1203 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 1181 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1199 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1218 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1187 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1175 aa  356  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1204 aa  347  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1202 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1230 aa  333  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1205 aa  330  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1219 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1190 aa  324  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.76 
 
 		 1111 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1219 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  26.05 
 
 		 1237 aa  294  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1136 aa  284  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1096 aa  278  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1027 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1119 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1135 aa  271  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 1119 aa  270  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1085 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 1140 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 1128 aa  247  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.05 
 
 		 1063 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.22 
 
 		 1080 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 1063 aa  244  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 1008 aa  238  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1034 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.16 
 
 		 1024 aa  236  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1008 aa  234  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1155 aa  231  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 971 aa  231  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 1080 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1131 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1142 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 976 aa  224  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1041 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 979 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 1087 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1018 aa  206  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1102 aa  205  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 1129 aa  205  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1046 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1023 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1119 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1029 aa  201  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1084 aa  201  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1163 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1079 aa  191  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1160 aa  191  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 1190 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1111 aa  188  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1024 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1051 aa  186  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 1090 aa  184  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 1095 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1048 aa  182  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1042 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1148 aa  178  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1114 aa  177  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 993 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1132 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1150 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1127 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1100 aa  176  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1189 aa  174  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1152 aa  174  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1101 aa  173  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1114 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1217 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 1127 aa  172  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1122 aa  171  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1119 aa  171  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1124 aa  169  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 1065 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1104 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1095 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 1144 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  22.42 
 
 		 1145 aa  163  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1177 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1143 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 1057 aa  162  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1123 aa  162  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1102 aa  161  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1146 aa  161  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1077 aa  161  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  30.07 
 
 		 1119 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1127 aa  160  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1024 aa  160  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1155 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  41.3 
 
 		 1023 aa  159  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>