More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0058 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 1202 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1185 aa  2417    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1161 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1218 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1181 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1189 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1229 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1203 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 1198 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1230 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1187 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1175 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1190 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1096 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1199 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 1211 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1198 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1204 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1205 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1219 aa  357  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1101 aa  354  4e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.17 
 
 		 1111 aa  314  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1023 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1219 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1085 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1114 aa  296  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1135 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 979 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1050 aa  288  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1136 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1062 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 1237 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1039 aa  282  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1043 aa  277  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1105 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1102 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1155 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 1014 aa  268  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1086 aa  267  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1034 aa  267  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1152 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1106 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1220 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 996 aa  263  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1006 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1150 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1010 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1013 aa  261  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1003 aa  259  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 999 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1051 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1164 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1017 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1158 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1127 aa  251  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1059 aa  250  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1122 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1161 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 989 aa  250  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1053 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1173 aa  249  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 982 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1177 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1050 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1028 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1070 aa  246  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.8 
 
 		 1019 aa  244  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1008 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1154 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 993 aa  241  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1144 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1096 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1041 aa  239  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1132 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1148 aa  238  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.29 
 
 		 1023 aa  237  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1113 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1039 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1023 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1163 aa  235  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1119 aa  234  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1076 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1048 aa  234  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1116 aa  234  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1018 aa  234  9e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1076 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1040 aa  232  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1168 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1034 aa  231  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 1030 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1155 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 986 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1103 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1024 aa  228  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1076 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1109 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1049 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1060 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 986 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1138 aa  224  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>