More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2894 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  42.35 
 
 		 1219 aa  946    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  49.63 
 
 		 1114 aa  1123    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1237 aa  2508    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  43.92 
 
 		 1135 aa  899    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  41.54 
 
 		 1219 aa  921    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  42.26 
 
 		 1119 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  42.88 
 
 		 1136 aa  897    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 1111 aa  413  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1220 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1114 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1203 aa  324  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1218 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1155 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1148 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1152 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1027 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1006 aa  294  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1198 aa  294  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1161 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1185 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1059 aa  277  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.56 
 
 		 1024 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.65 
 
 		 1019 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1079 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1066 aa  272  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1010 aa  272  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1124 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1154 aa  271  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1017 aa  268  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1181 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1181 aa  267  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1049 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1028 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1163 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1173 aa  264  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 1023 aa  263  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1034 aa  263  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 1019 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 996 aa  262  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1179 aa  262  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 1102 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1037 aa  261  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27 
 
 		 925 aa  261  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  26.2 
 
 		 1002 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  26.65 
 
 		 1018 aa  259  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1205 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1086 aa  257  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 1199 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1042 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1161 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1023 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1202 aa  254  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1053 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1039 aa  253  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1003 aa  252  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 999 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1146 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1008 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 996 aa  251  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1154 aa  251  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 1119 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1147 aa  249  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  24.96 
 
 		 1211 aa  247  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1198 aa  246  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 1142 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 979 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 993 aa  244  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1081 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1177 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1105 aa  244  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1137 aa  244  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1033 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1014 aa  243  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1154 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 1041 aa  240  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 1189 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1155 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1031 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1024 aa  237  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1122 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1230 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 1175 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1060 aa  236  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 1035 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1204 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1008 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1202 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 984 aa  228  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1099 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1026 aa  225  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1079 aa  225  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 1023 aa  224  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1187 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 1005 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 1080 aa  221  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1089 aa  221  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 992 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1117 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1101 aa  215  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>