More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3802 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  43.42 
 
 		 1229 aa  1027    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1211 aa  2454    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  42.01 
 
 		 1101 aa  841    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1161 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1198 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1205 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1204 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1230 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1185 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 1181 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1203 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1218 aa  353  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1202 aa  353  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1199 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1187 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 1111 aa  338  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1198 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1175 aa  333  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1190 aa  331  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1219 aa  327  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1096 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1034 aa  290  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1160 aa  283  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1012 aa  283  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1220 aa  282  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 1017 aa  279  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1219 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1175 aa  273  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1135 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 1106 aa  270  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1085 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1136 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1077 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1116 aa  259  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 996 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1105 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1027 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1086 aa  254  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1154 aa  253  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1076 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 999 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1120 aa  248  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.96 
 
 		 1237 aa  247  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 1147 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 979 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1181 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1202 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1023 aa  245  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1079 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1158 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 1129 aa  244  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1146 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1049 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1037 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 1080 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 982 aa  242  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 986 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1039 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.6 
 
 		 1023 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 1037 aa  238  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1114 aa  237  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1028 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1047 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1077 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1164 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 1148 aa  234  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 1144 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 994 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 1177 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1155 aa  231  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1028 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.04 
 
 		 1080 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1094 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 993 aa  228  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 1063 aa  227  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 994 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1036 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1084 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1119 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1085 aa  224  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 1155 aa  221  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1066 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1038 aa  221  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1066 aa  220  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1163 aa  220  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 986 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 1050 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1053 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 1094 aa  218  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1137 aa  218  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1006 aa  218  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1131 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 1154 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1064 aa  216  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.57 
 
 		 1019 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1003 aa  214  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.66 
 
 		 925 aa  214  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1023 aa  212  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1026 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>