More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2947 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1161 aa  2379    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1203 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1229 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1205 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1204 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 		 1211 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1199 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1202 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1185 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1218 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 1181 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1198 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 1189 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1187 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1175 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1101 aa  416  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1190 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1230 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1096 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1198 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1220 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 1111 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1219 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1062 aa  321  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1219 aa  315  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1136 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1155 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1135 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1132 aa  295  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  25.02 
 
 		 1237 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1129 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1177 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1085 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1154 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1127 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 979 aa  271  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1113 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1160 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1119 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1028 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1140 aa  261  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1006 aa  260  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 1120 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1028 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1006 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1163 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1003 aa  258  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1164 aa  254  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1146 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1053 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1076 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1114 aa  248  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1086 aa  247  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 1005 aa  245  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1114 aa  244  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1017 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1152 aa  244  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1137 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1066 aa  242  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1105 aa  241  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1071 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1042 aa  237  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1019 aa  236  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1039 aa  235  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 1080 aa  234  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1012 aa  234  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1008 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1102 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1181 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1148 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1076 aa  229  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1119 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1065 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 986 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1080 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1076 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 993 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1103 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1084 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1057 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1094 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1037 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1036 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1147 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1103 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  22.45 
 
 		 1122 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 1020 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  24.53 
 
 		 1030 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 994 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1071 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  24.36 
 
 		 1041 aa  216  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1188 aa  216  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 1014 aa  215  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1063 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1117 aa  214  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1047 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1050 aa  212  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 1033 aa  211  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1143 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 1090 aa  209  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>