More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1074 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  44.12 
 
 		 1136 aa  928    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  49.63 
 
 		 1237 aa  1123    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  43.73 
 
 		 1119 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1114 aa  2283    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  45.94 
 
 		 1219 aa  996    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  46.16 
 
 		 1219 aa  962    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  45.31 
 
 		 1135 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 1111 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1220 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1185 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1203 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1027 aa  294  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1114 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1051 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1006 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 1140 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1124 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1102 aa  277  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1181 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1000 aa  272  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1137 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1012 aa  269  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1010 aa  270  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1218 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 1003 aa  268  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1040 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 993 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1037 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1189 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 975 aa  266  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1160 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 1023 aa  264  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1129 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1024 aa  262  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1020 aa  261  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1148 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1132 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1028 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 999 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1064 aa  257  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 1080 aa  257  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1076 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1028 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1013 aa  257  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1043 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1039 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1202 aa  253  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1062 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1096 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1019 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 1181 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1010 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 1005 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1076 aa  248  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1117 aa  248  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 1090 aa  247  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 1041 aa  245  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1105 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1161 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  24.78 
 
 		 1030 aa  244  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 996 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 1144 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1014 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 997 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1026 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1039 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1066 aa  240  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 992 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 1211 aa  237  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1006 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 1198 aa  234  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 1023 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 1020 aa  234  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1018 aa  233  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1006 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1127 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1152 aa  231  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1079 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1081 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1012 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1122 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1042 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1008 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1025 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1059 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 1029 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1071 aa  228  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1101 aa  227  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1168 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 1016 aa  224  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 1033 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1077 aa  224  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 1063 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 1106 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 984 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  25.15 
 
 		 1063 aa  222  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 977 aa  221  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1094 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 988 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1085 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>