More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3749 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  56.77 
 
 		 1219 aa  1250    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  43.92 
 
 		 1237 aa  899    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  56.71 
 
 		 1219 aa  1266    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  45.31 
 
 		 1114 aa  951    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1135 aa  2320    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  58.26 
 
 		 1136 aa  1283    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  52.99 
 
 		 1119 aa  1151    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  28.85 
 
 		 1111 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1220 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1203 aa  347  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1010 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1062 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1006 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1181 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1161 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1079 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1185 aa  293  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 989 aa  292  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1181 aa  288  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1177 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1096 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1051 aa  281  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1137 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1039 aa  278  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 1035 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 1211 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1024 aa  272  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1021 aa  272  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1198 aa  271  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1122 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1066 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1124 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1114 aa  265  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1053 aa  264  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1081 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1175 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1050 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1049 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1059 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1154 aa  260  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1023 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1158 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 992 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1042 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1198 aa  258  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1140 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1204 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.8 
 
 		 1030 aa  253  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 1154 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 1041 aa  251  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 1026 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1006 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 1080 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 994 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1154 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 1063 aa  247  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1060 aa  247  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1034 aa  247  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 979 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 1019 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26 
 
 		 1023 aa  246  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1025 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1079 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 994 aa  244  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1103 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1173 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 993 aa  242  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1198 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1023 aa  241  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1101 aa  240  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1064 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1071 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1003 aa  238  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1096 aa  238  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1130 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1142 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 1003 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1034 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1199 aa  234  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 1037 aa  234  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1008 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1117 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1105 aa  232  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 1079 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1155 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1017 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1058 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1059 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1205 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1040 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1077 aa  228  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1164 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1031 aa  226  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1006 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1103 aa  224  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1013 aa  224  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1117 aa  224  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1190 aa  224  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>