More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2881 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1205 aa  2445    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  52.75 
 
 		 1204 aa  1250    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1161 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1199 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1181 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1229 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1203 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 1211 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1230 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1218 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1187 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1190 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1185 aa  370  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1219 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1198 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1189 aa  335  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1202 aa  332  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1175 aa  331  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1096 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1198 aa  318  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1220 aa  297  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1101 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 1111 aa  272  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1219 aa  267  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.05 
 
 		 1237 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1163 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1085 aa  254  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1158 aa  242  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1124 aa  241  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1131 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1135 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1114 aa  229  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1119 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1130 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1062 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1136 aa  221  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1148 aa  217  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 1177 aa  212  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 986 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1155 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 1154 aa  209  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 1152 aa  209  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1080 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1050 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1164 aa  204  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1127 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 		 1114 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 1086 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1132 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1138 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1113 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1169 aa  198  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1106 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1123 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 971 aa  194  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1127 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1140 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1071 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1146 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1038 aa  191  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  23.31 
 
 		 1019 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 1175 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1105 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 993 aa  187  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1198 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1028 aa  187  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1024 aa  187  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1150 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1192 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1038 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1039 aa  186  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 1154 aa  184  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1034 aa  184  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 1006 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1090 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1027 aa  183  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  25.61 
 
 		 1047 aa  181  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1116 aa  181  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1014 aa  181  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 1217 aa  181  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 1071 aa  181  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1138 aa  180  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1043 aa  178  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1166 aa  178  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1096 aa  177  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1039 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1129 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1023 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1127 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 1040 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1101 aa  175  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1066 aa  175  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1076 aa  174  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1079 aa  174  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1109 aa  174  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 1041 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 986 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  35.28 
 
 		 1109 aa  172  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1076 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1176 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>