More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2080 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1158 aa  2361    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1086 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 992 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 994 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1154 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1154 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1127 aa  366  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1116 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1079 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1155 aa  364  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1050 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1006 aa  361  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1124 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 982 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1062 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1120 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 999 aa  351  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1129 aa  350  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1161 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1043 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1027 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1114 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1177 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 1080 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 989 aa  345  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1132 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1177 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 994 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1163 aa  337  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1164 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1154 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  28.38 
 
 		 925 aa  334  7.000000000000001e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1014 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1096 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 996 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1109 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1010 aa  328  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1037 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1089 aa  327  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1122 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1000 aa  325  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 986 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1138 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1119 aa  323  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1051 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1017 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1150 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 986 aa  317  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1062 aa  314  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1076 aa  313  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1097 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1152 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1077 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1087 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1109 aa  311  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1155 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1038 aa  310  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1028 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1026 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1051 aa  308  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 979 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 1025 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1181 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1102 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1034 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1013 aa  304  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1131 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1070 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1117 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1106 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1023 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1076 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1137 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.31 
 
 		 1019 aa  295  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1116 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 1071 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1172 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1101 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1039 aa  293  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1028 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1053 aa  292  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1003 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1050 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1113 aa  291  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1192 aa  291  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1164 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1020 aa  290  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1101 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1049 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1063 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1021 aa  288  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1076 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1059 aa  288  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1018 aa  288  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1085 aa  287  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 1065 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1036 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1175 aa  284  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>