More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6427 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1101 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  40.07 
 
 		 1119 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  40.62 
 
 		 1007 aa  670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  38.8 
 
 		 1011 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1102 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1089 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1101 aa  2241    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  36.7 
 
 		 1127 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  39.35 
 
 		 1080 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1093 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  37.19 
 
 		 1109 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  37.1 
 
 		 1092 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.76 
 
 		 1109 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 		 1099 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 1138 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  37.34 
 
 		 1089 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  36.85 
 
 		 1111 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  38.48 
 
 		 1009 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1113 aa  613  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1108 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  38.78 
 
 		 1014 aa  559  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  38.47 
 
 		 894 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1127 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1132 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1177 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1116 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1104 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1050 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1128 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1161 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1066 aa  357  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1037 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1038 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1000 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1023 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1071 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1079 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1140 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 1041 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1097 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1154 aa  337  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1114 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1110 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1051 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1122 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1163 aa  333  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1173 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1028 aa  332  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1027 aa  330  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1155 aa  330  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 1029 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1077 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 982 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1008 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1071 aa  327  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1150 aa  326  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1076 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1019 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1129 aa  324  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1006 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1124 aa  324  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1013 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1181 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1117 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1010 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1148 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1152 aa  318  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 989 aa  317  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.53 
 
 		 1019 aa  317  7e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 999 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1120 aa  317  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1053 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1023 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  30.52 
 
 		 925 aa  313  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1039 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1038 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1025 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1076 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 996 aa  308  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1051 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1106 aa  307  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 986 aa  307  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1146 aa  304  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1076 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1116 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 979 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 993 aa  301  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.79 
 
 		 1024 aa  300  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1103 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 996 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1168 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1154 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1119 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1081 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1043 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1102 aa  297  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1049 aa  297  9e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 994 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1096 aa  293  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>