More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4660 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 894 aa  1818    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  44.78 
 
 		 1109 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  40.31 
 
 		 1138 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  41.45 
 
 		 1113 aa  643    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  42.89 
 
 		 1089 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  42.66 
 
 		 1101 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1127 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  43.79 
 
 		 1007 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  40.54 
 
 		 1109 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  43.16 
 
 		 1011 aa  612  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  40.54 
 
 		 1099 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  40.07 
 
 		 1102 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  40.22 
 
 		 1111 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  41.9 
 
 		 1009 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  39.86 
 
 		 1119 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  39.38 
 
 		 1089 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  39.26 
 
 		 1093 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  37.59 
 
 		 1108 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  37.75 
 
 		 1080 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  38.47 
 
 		 1101 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  43.68 
 
 		 1014 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1092 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  33.41 
 
 		 1127 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1104 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1177 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1132 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1129 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1110 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1124 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1154 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1120 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1071 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1097 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1155 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1023 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1154 aa  295  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1122 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1163 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1116 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1027 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1150 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1038 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1116 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1077 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1096 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 1014 aa  284  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1154 aa  283  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1181 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1117 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1161 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1148 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1006 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1128 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1062 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1029 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1079 aa  274  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1086 aa  274  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 1043 aa  274  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 1140 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1114 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1076 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1177 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1161 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1060 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1008 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1146 aa  270  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 1019 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1155 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 1050 aa  267  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 997 aa  266  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1152 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1094 aa  265  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1139 aa  263  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1006 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1127 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1066 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1051 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 989 aa  258  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1147 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1076 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1023 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1039 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1138 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 1038 aa  251  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1081 aa  250  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1037 aa  250  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1037 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1143 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1173 aa  249  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.82 
 
 		 1019 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 1041 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1106 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 1144 aa  247  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 979 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 994 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1040 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1039 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1123 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1087 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1028 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>