More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3556 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  42.43 
 
 		 1093 aa  745    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  38.8 
 
 		 1101 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  57.21 
 
 		 1007 aa  1154    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1011 aa  2064    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  56.47 
 
 		 1009 aa  1130    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  39.74 
 
 		 1089 aa  685    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  39.4 
 
 		 1127 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  40.75 
 
 		 1113 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.79 
 
 		 1109 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  38.66 
 
 		 1102 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  39.26 
 
 		 1099 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  40.06 
 
 		 1080 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  40.32 
 
 		 1111 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  43.72 
 
 		 1101 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  44.23 
 
 		 1109 aa  781    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  40.98 
 
 		 1119 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.33 
 
 		 1089 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  37.19 
 
 		 1138 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 1092 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  39.98 
 
 		 1014 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  43.16 
 
 		 894 aa  612  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1108 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  34.54 
 
 		 1127 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1104 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1023 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1010 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1027 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1110 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1014 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1043 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 999 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1161 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1037 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1128 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1038 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1116 aa  351  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1019 aa  350  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1008 aa  345  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1120 aa  344  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1050 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1079 aa  339  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1029 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1124 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1028 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1039 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.64 
 
 		 1019 aa  331  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1066 aa  330  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 		 1041 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1025 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1013 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1097 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1147 aa  325  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1012 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1071 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 994 aa  324  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1053 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1148 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.37 
 
 		 1024 aa  322  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1071 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1177 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.14 
 
 		 1023 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1103 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1122 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1173 aa  317  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 986 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1155 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1023 aa  314  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1096 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1077 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1000 aa  312  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  30.01 
 
 		 925 aa  312  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1076 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 1047 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1076 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1006 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 989 aa  309  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 1026 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 979 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1017 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 996 aa  308  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1076 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1063 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 986 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1028 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1132 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1117 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1102 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 996 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1106 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 982 aa  303  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1049 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1154 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1038 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1039 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1075 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1051 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1129 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 997 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1036 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1026 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>