More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4609 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  38.65 
 
 		 1138 aa  766    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  39.73 
 
 		 1102 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  40.47 
 
 		 1109 aa  765    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  38.91 
 
 		 1007 aa  683    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 1108 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  39.74 
 
 		 1011 aa  685    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  42.89 
 
 		 894 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  39.8 
 
 		 1009 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  37.81 
 
 		 1089 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 1113 aa  705    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  38.08 
 
 		 1119 aa  680    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.32 
 
 		 1109 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1089 aa  2224    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  39.15 
 
 		 1101 aa  747    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1101 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  38.53 
 
 		 1099 aa  702    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  43.05 
 
 		 1111 aa  879    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  39.94 
 
 		 1093 aa  744    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  42.03 
 
 		 1127 aa  853    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 		 1080 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  39.52 
 
 		 1014 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1092 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1127 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1104 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1177 aa  420  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1110 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1124 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1129 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1161 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 1037 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1155 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1097 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1116 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1128 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 1140 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 997 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1010 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1116 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1132 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1027 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1154 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1181 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1079 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1150 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1120 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1154 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1114 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1050 aa  353  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1160 aa  353  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1029 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1043 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1152 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1038 aa  347  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1102 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1127 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1079 aa  346  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1148 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 1019 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.97 
 
 		 925 aa  336  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1077 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 986 aa  334  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1006 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1139 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1039 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1039 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1071 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 999 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1154 aa  328  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 1158 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.56 
 
 		 1019 aa  326  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1119 aa  325  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1146 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1172 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1173 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1128 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1066 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1000 aa  322  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 989 aa  322  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 982 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1049 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1062 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1049 aa  320  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1051 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1177 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1076 aa  317  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1028 aa  317  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1106 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1094 aa  316  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 1041 aa  316  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1071 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1117 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1147 aa  314  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1060 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1028 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1066 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1051 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1164 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>