More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5562 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1101 aa  708    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  40.94 
 
 		 1093 aa  798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  41.11 
 
 		 1007 aa  720    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  40.06 
 
 		 1011 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1109 aa  787    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  41.96 
 
 		 1009 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 1113 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  39.18 
 
 		 1101 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  40.02 
 
 		 1119 aa  810    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  37.18 
 
 		 1108 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1092 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  37.7 
 
 		 1138 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1127 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1080 aa  2220    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 1089 aa  710    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  37.55 
 
 		 1109 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  38.55 
 
 		 1099 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1111 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  36.4 
 
 		 1102 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 1089 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  41.32 
 
 		 1014 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1127 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 894 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1110 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1104 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1116 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1155 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1027 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1120 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 989 aa  410  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 982 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1177 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1010 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1161 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 999 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1043 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1014 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1023 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1122 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 1140 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1119 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 986 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1038 aa  380  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1114 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1128 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1129 aa  380  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1124 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1181 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1071 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1019 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.76 
 
 		 1019 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1000 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1037 aa  370  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1066 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.07 
 
 		 1041 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1106 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1154 aa  362  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 1028 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1116 aa  360  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 1154 aa  360  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1097 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.79 
 
 		 1024 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1155 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 992 aa  354  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1086 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1177 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1058 aa  351  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1079 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1148 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1146 aa  348  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 1023 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1102 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1163 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1050 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1029 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 979 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1139 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1006 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 997 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1109 aa  338  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1021 aa  337  7.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1062 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1172 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1039 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1152 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1012 aa  334  5e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1071 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1077 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1028 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1039 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1144 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1059 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1147 aa  330  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1173 aa  330  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1051 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1137 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1117 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1154 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1079 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>