More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1983 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  39.26 
 
 		 1119 aa  722    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  38.64 
 
 		 1080 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1101 aa  2238    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  43.39 
 
 		 1007 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  40.7 
 
 		 1093 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  48.6 
 
 		 1113 aa  1021    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  43.62 
 
 		 1011 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 		 1127 aa  783    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  43.63 
 
 		 1109 aa  883    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  42.63 
 
 		 1009 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  38.08 
 
 		 1108 aa  712    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  38.61 
 
 		 1109 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1102 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  40.85 
 
 		 1111 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  42.89 
 
 		 894 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  38.33 
 
 		 1099 aa  712    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1101 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  37.62 
 
 		 1089 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  39.72 
 
 		 1138 aa  807    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  39.15 
 
 		 1089 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1092 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1127 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  38.13 
 
 		 1014 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1177 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1104 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1132 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1129 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1110 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1155 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1128 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1023 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1146 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1161 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1116 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1027 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 1037 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 1140 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1124 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 1014 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1097 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1181 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 999 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1154 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1010 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1163 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1114 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1013 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1154 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 982 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1120 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1122 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1006 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 1050 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1071 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.84 
 
 		 1019 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1154 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1127 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1038 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1028 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 1019 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1173 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1150 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1148 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1077 aa  363  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 979 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1066 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.38 
 
 		 1041 aa  362  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1051 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1155 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1152 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 989 aa  359  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1096 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1039 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1039 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1025 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1038 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1053 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1106 aa  350  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1060 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1143 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1062 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1049 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1076 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1079 aa  347  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1017 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.55 
 
 		 925 aa  344  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1087 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1008 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1006 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1131 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1086 aa  341  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 997 aa  341  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1076 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1051 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1168 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 994 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1076 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 996 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>