More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2079 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1028 aa  2086    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  49.27 
 
 		 1024 aa  991    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  59.84 
 
 		 1019 aa  1245    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  49.9 
 
 		 999 aa  965    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  55.11 
 
 		 1043 aa  1082    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  51.28 
 
 		 1014 aa  1006    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  41.63 
 
 		 1120 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1161 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  36.53 
 
 		 1010 aa  559  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1023 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  35.41 
 
 		 1041 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1027 aa  539  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1039 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 986 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1114 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 1037 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 982 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1140 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1177 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1038 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1181 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 989 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1079 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1071 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1050 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1019 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1012 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1132 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1006 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1066 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1129 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 1071 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1116 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 1029 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1008 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1155 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1117 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1026 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1128 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1173 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 997 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  31.91 
 
 		 925 aa  445  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1154 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1124 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1147 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1051 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 1023 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 996 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1025 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1028 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1051 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1097 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1155 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 979 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1076 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 1000 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1080 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 994 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1006 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1017 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1103 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1060 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1164 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1076 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1021 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1039 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1038 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1076 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1059 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1122 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.81 
 
 		 1063 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1152 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1023 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1053 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1066 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 		 1047 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1081 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1096 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1036 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 992 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 1011 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 1034 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1014 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1177 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1163 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1060 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1036 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1036 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1154 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1006 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1154 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1040 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1049 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1063 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1033 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1150 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 1065 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 1035 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1102 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>