More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3164 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  39.94 
 
 
1089 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  41.11 
 
 
1109 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 
1099 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  43.22 
 
 
1007 aa  742    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  42.43 
 
 
1011 aa  761    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 
1109 aa  768    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  39.4 
 
 
1089 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  41.84 
 
 
1009 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 
1102 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 
1014 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 
1101 aa  717    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  41.49 
 
 
1080 aa  809    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  38.12 
 
 
1113 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 
1092 aa  684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  43.66 
 
 
1119 aa  860    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1093 aa  2212    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 
1127 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 
1127 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  40.33 
 
 
1138 aa  791    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  39.23 
 
 
1108 aa  745    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 
1111 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  40.7 
 
 
1101 aa  742    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  39.26 
 
 
894 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 
1104 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 
1110 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 
1161 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 
1114 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 
1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 
1019 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 
1097 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 
1155 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 
1132 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 
1043 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 
1177 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 
1010 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 
1152 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 
1116 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 
1037 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1038 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 
1128 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 
1124 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 
982 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 
999 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 
1027 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 
1155 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 
1117 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 
1148 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 
1006 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 
1120 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 
1008 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
1140 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 
1129 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 
1181 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 
1029 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 
1106 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 
986 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 
1079 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 
1177 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 
997 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 
1076 aa  366  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31 
 
 
1014 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 
1013 aa  360  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 
1076 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 
1076 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 
989 aa  358  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 
1041 aa  357  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 
1066 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.58 
 
 
1019 aa  355  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 
1102 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 
1051 aa  353  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  30.07 
 
 
925 aa  353  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 
1122 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 
986 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
1144 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 
1051 aa  351  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
1154 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 
1116 aa  350  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 
1154 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 
1147 aa  350  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 
1173 aa  348  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 
1096 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 
1039 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
1050 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 
1028 aa  347  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 
1077 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 
1006 aa  344  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 
1039 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 
1053 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 
1023 aa  341  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 
1071 aa  340  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 
1071 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 
979 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 
1059 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 
1096 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 
1066 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 
1119 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 
1103 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 
1161 aa  335  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
1094 aa  333  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 
1000 aa  333  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>