More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3808 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1138 aa  708    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1127 aa  2314    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1104 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 1093 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1109 aa  632  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 		 1110 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1109 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1080 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1089 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1119 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1101 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1099 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1108 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1092 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1089 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1102 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  35.38 
 
 		 1007 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1111 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1113 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1127 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1014 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  35.08 
 
 		 1009 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  34.54 
 
 		 1011 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1101 aa  506  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 894 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1010 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1014 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1120 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1116 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 997 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 1071 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1027 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1124 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1097 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1140 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1114 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 1043 aa  307  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1181 aa  307  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 1019 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1037 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1161 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1177 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1177 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1079 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1008 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1132 aa  298  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1128 aa  297  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1006 aa  294  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 982 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 986 aa  292  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1000 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 999 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1029 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 989 aa  288  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 1041 aa  288  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1154 aa  288  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1119 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1129 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1152 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1023 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1117 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1080 aa  284  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.38 
 
 		 925 aa  281  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1017 aa  281  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 996 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1038 aa  280  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1154 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1012 aa  277  8e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1079 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1116 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1049 aa  275  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 986 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1148 aa  275  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1130 aa  275  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1028 aa  273  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1021 aa  272  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1137 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 992 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1155 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1155 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1051 aa  271  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1066 aa  271  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1172 aa  271  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1006 aa  270  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1039 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1028 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1150 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1023 aa  265  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1122 aa  265  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1139 aa  264  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1173 aa  263  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1047 aa  263  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1102 aa  262  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1033 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1066 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1119 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1147 aa  257  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1026 aa  257  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1096 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1058 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>