More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0754 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1038 aa  2111    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  39.01 
 
 		 1066 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1132 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 1173 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  37.52 
 
 		 1039 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  38.77 
 
 		 1000 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  40.28 
 
 		 1041 aa  709    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 1124 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1181 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 1081 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  39.76 
 
 		 1117 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  40.84 
 
 		 1177 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  42.03 
 
 		 1029 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  40.27 
 
 		 1006 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1155 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  41.16 
 
 		 1114 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 1050 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  45.33 
 
 		 1037 aa  849    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  37.57 
 
 		 1028 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 1079 aa  636    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  39.98 
 
 		 1019 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  41.19 
 
 		 1008 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  40.1 
 
 		 1128 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  45.48 
 
 		 1161 aa  854    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  39.3 
 
 		 1097 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  38.6 
 
 		 982 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 		 986 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1116 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 1051 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  37.76 
 
 		 1071 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 1026 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  36.61 
 
 		 1163 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 1071 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  37.91 
 
 		 1023 aa  620  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  37.88 
 
 		 1063 aa  620  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 1025 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1155 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1148 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 1010 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  37.62 
 
 		 1060 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 989 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 1129 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  38.83 
 
 		 1034 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 		 1051 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 1033 aa  598  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1152 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.28 
 
 		 1059 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  37.43 
 
 		 1096 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1122 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 1038 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1006 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 1053 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1039 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  37.09 
 
 		 1023 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1147 aa  576  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 1154 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1027 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1150 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.03 
 
 		 1012 aa  571  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1103 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 996 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1076 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1076 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 1065 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 1119 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1023 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 1076 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1006 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1017 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1198 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 994 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 1041 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1096 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1085 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1062 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1164 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 999 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  35.3 
 
 		 1075 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 1023 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 996 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 979 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1036 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.27 
 
 		 1005 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 1020 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1064 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 1043 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1102 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1042 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 1140 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  34.95 
 
 		 1019 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1079 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1071 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 1010 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  34.89 
 
 		 1043 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1021 aa  521  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1049 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1023 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1066 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1154 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 1177 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>