More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1153 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  40.13 
 
 		 1049 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  49.67 
 
 		 1080 aa  1068    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1063 aa  2161    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 1080 aa  775    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 1053 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1028 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1059 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 1132 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1051 aa  549  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1096 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1152 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1163 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1150 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1161 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1040 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 982 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 989 aa  509  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1154 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 1037 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 986 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 1029 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1038 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1124 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1128 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1177 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1155 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1066 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1181 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1021 aa  469  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1114 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1008 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1039 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.4 
 
 		 1063 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1010 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1164 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 1000 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1116 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1006 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1023 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1117 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1071 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1097 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1027 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 996 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1079 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.49 
 
 		 1043 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1177 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 1041 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1039 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1076 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 994 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 1038 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1012 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1071 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1064 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1137 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 1026 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1006 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1006 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 1071 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 1043 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1155 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.32 
 
 		 1002 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1017 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 996 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1147 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1019 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1004 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1148 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1119 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1025 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1010 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1172 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1192 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1179 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 979 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 1011 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1137 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1058 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1173 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1122 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1127 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1060 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 1128 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1077 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1129 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1075 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 1144 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1139 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1043 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 1023 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1062 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1082 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1047 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1023 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1051 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1154 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>