More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5147 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3288  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1128 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0970492  hitchhiker  0.00551669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1164 aa  2402    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1148 aa  632  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1158 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1062 aa  302  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1124 aa  297  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1010 aa  294  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1116 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1132 aa  277  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1138 aa  275  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1203 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1037 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1154 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1154 aa  267  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1077 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 996 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1097 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1220 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 992 aa  258  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 1086 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1114 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1109 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1006 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1028 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1000 aa  254  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1161 aa  254  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1017 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 1099 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1147 aa  249  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 979 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.69 
 
 		 925 aa  247  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1120 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1128 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1181 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1177 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1163 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1168 aa  244  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 986 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1027 aa  241  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1113 aa  241  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 1119 aa  241  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 		 1152 aa  240  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1161 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1129 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1089 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1150 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 1140 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 1029 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1053 aa  238  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1023 aa  237  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 1219 aa  237  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1008 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1034 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 1090 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1123 aa  235  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1116 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1102 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 894 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1023 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1119 aa  231  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 996 aa  231  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1023 aa  230  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1050 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 982 aa  228  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1070 aa  227  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1041 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1173 aa  227  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1008 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 1144 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 1155 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1101 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  25.12 
 
 		 1035 aa  226  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 993 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1192 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1079 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1187 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 1154 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 1175 aa  222  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1006 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 1030 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  23.96 
 
 		 1117 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 997 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1060 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 1041 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 996 aa  220  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1125 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 1172 aa  218  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1026 aa  217  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1051 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 977 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 1080 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1102 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1105 aa  215  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1013 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 994 aa  214  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 1025 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1080 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 1093 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1127 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1177 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>