More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3288 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3288  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1128 aa  2312    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0970492  hitchhiker  0.00551669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1164 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1148 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1127 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1116 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1168 aa  254  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 1124 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1132 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1070 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1053 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1086 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 1128 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1097 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1155 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 986 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1109 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1023 aa  235  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1154 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1177 aa  230  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1122 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1163 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 1114 aa  228  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1008 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1143 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1150 aa  226  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1120 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1027 aa  224  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1049 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1010 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 1043 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1181 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 992 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 1037 aa  217  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1139 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 1006 aa  214  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 1038 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 996 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.64 
 
 		 925 aa  213  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1006 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 1161 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1113 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1006 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1076 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1152 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1117 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1090 aa  209  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1154 aa  208  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1023 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.41 
 
 		 1111 aa  207  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 1181 aa  205  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 1008 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1079 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 1102 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1026 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 1144 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 1062 aa  201  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1042 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 1102 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1059 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  23.69 
 
 		 1155 aa  198  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 999 aa  197  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  23.06 
 
 		 1119 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1161 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 1021 aa  196  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 1154 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1017 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 1158 aa  194  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1096 aa  194  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 1014 aa  194  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1039 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1096 aa  194  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1051 aa  194  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  24 
 
 		 1017 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1029 aa  193  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1028 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 1080 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1146 aa  191  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1066 aa  191  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  22.44 
 
 		 1177 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1013 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 1190 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 1019 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 1058 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1034 aa  188  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 971 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 		 1131 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 996 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 1140 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1028 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1147 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1060 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 994 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 1005 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 993 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 1059 aa  182  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 1177 aa  182  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 1038 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 1000 aa  181  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1051 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 1094 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>