More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3337 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1119 aa  2259    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1062 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1177 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1010 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1119 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1080 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1109 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1109 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1116 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1023 aa  310  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1129 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1154 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1027 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 994 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 997 aa  298  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1066 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1023 aa  294  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.12 
 
 		 925 aa  292  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1128 aa  293  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1140 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1019 aa  292  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1160 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1127 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1177 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1099 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1155 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1113 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1071 aa  284  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 1007 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1094 aa  283  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1173 aa  283  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1101 aa  281  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1109 aa  280  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1039 aa  280  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1077 aa  277  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1086 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1154 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1037 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 1158 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1122 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1006 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1181 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1119 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1120 aa  268  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1000 aa  267  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1161 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1004 aa  265  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1038 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 1152 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.49 
 
 		 1024 aa  263  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1089 aa  262  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1111 aa  260  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1090 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1102 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1043 aa  258  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1014 aa  258  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1034 aa  257  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1132 aa  257  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 986 aa  257  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1036 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1124 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 1004 aa  254  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1011 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 		 1009 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1071 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1164 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1148 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 1035 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1076 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 1041 aa  250  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.35 
 
 		 1111 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1127 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 989 aa  249  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1021 aa  248  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1102 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 982 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1154 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 1050 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1023 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1155 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1114 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1029 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1051 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1089 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1150 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1103 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 1005 aa  244  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1106 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 999 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 1080 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1079 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1137 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1024 aa  243  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 996 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1028 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1028 aa  241  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 1028 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 894 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1113 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 994 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>